Fue asesorada para el doctorado por Gerd Brunk y Heinrich Edwin Fiedler, profesor en el Departamento de Dinámica de Fluidos desde1972. Este Departamento formaba parte del Instituto Hermann-Föttinger de Mecánica de Fluidos de la Universidad Técnica de Berlín. Masanja obtuvo su doctorado en 1986 por su tesis Un estudio numérico de un fluido Reiner-Rivlin en una tubería circular Axi-Symmetrical. Se convirtió así en la primera mujer de Tanzania en obtener un doctorado en matemáticas.

03 abril 2021